Nunca dudes entre la palabra empequeñece y el término empequeñeze cuando quieras escribir, dado que únicamente existe una manera viable para escribir esta palabra de forma correcta, y es: empequeñece. La palabra empequeñeze simplemente no aparece en el diccionario de la Real Academia de la Lengua Española.
Con el propósito de que encuentres un sistema que te ayude a recordar la forma en que se debe escribir empequeñece, la definición del diccionario:
La inseguridad cuando debemos escribir términos que incluyen las letras ‘s’ y ‘c’ se da con más frecuencia en aquellas áreas en que las dos se pronuncian igual. Esto ocurre primordialmente en los países latinoamericanos en los cuales se habla español, aunque también de igual modo en algunas áreas del sur de la Península Ibérica y las Islas Canarias. No es nuestro deseo aportar teorías respecto al porqué de esta pronunciación, porque no se corresponde con el objetivo de esta web, solamente queremos señalar que sea como sea, esta manera de pronunciar está aprobada. Igualmente {cabe apuntar|es preciso decir que la confusión entre ‘s’ y ‘c’ tan solo se puede dar en ciertas circunstancias, ya que la letra ‘c’ cuando antecede a las vocales ‘a’, ‘o’ y ‘u’ bajo ninguna circunstancia se pronuncia de manera semejante a /s/, sino que se pronuncia como /k/, por lo cual no tendría que haber ningún tipo de confusión en estas circunstancias. Respecto al resto, recomendamos escuchar la pronunciación las palabras en español de España estándar, como forma de aprender a diferenciar cuándo se debe escribir la letra ‘s’ y cuándo la letra ‘c’. Y ciertamente, seguir esta web y estudiar las normas ortográficas que hemos recopilado para ti en la portada de esta web. De esta forma nunca más sentirás dudas sobre si el término que quieres escribir se escribe empequeñece o es la palabra empequeñeze.