Nunca deberías dudar entre el término comayagua y el término comallagua a la hora de escribir, puesto que tan solo nos encontramos con una forma viable de escribir este término correctamente, y es: comayagua. El término comallagua simplemente no corresponde a ninguna palabra que se encuentre en el diccionario de la Real Academia de la Lengua Española.
La inseguridad en el momento de escribir vocablos que contienen las letras ‘s’ y ‘c’ se da más frecuentemente en aquellos sitios en que ambas dos se pronuncian igual. Esto se produce primordialmente en los países latinoamericanos en los que hablan en lengua española, aunque también de igual manera en algunas regiones del sur de España y las Islas Canarias. No vamos a entrar a trazar teorías respecto al porqué de esta pronunciación, dado que no es el objetivo de esta web, únicamente deseamos indicar que sea como sea, esta manera de pronunciar está aprobada. Igualmente {cabe decir|es preciso decir que la confusión entre las letras ‘s’ y ‘c’ tan solo puede aparecer en determinadas circunstancias, ya que la letra ‘c’ cuando antecede a las vocales ‘a’, ‘o’ y ‘u’ nunca jamás se pronuncia de modo similar a /s/, sino que suena como /k/, por lo que no debería de existir ningún tipo de confusión por este motivo. Con relación a lo demás, quisiéramos recomendarte escuchar la manera de pronunciar las palabras en español de la Península Ibérica estándar, como forma de aprender a diferenciar cuándo es preciso escribir ‘s’ y cuándo la letra ‘c’. Y ciertamente, seguir esta página web y aprender las normas ortográficas que hemos juntado para ti en el inicio de este sitio web. De esta forma nunca más tendrás dudas sobre si la palabra que pretendes escribir se escribe comayagua o es la palabra comallagua.