Jamás deberías dudar entre subsecretaría y la palabra cubcecretaría cuando debas escribir, dado que tan solo existe una forma posible de escribir este término con corrección, y es: subsecretaría. El término cubcecretaría simplemente no se encuentra en el diccionario de la RAE.
Las dudas que aparecen cuando hay que escribir palabras que comprenden las letras ‘s’ y ‘c’ se da más frecuentemente en aquellas zonas en donde ambas dos se pronuncian de manera idéntica. Esto se produce fundamentalmente en los países latinoamericanos en los cuales hablan en español, aunque también en algunas áreas del sur de la Península Ibérica y las Islas Canarias. No deseamos exponer teorías con relación al porqué de esta pronunciación, dado que no se corresponde con el objetivo de este sitio web, solamente queremos apuntar a que sea como sea, esta manera de pronunciar está aceptada. Asimismo {cabe destacar|es preciso decir que la confusión entre ‘s’ y ‘c’ tan solo puede darse en algunas circunstancias, debido a que la letra ‘c’ delante de las vocales ‘a’, ‘o’ y ‘u’ en ninguna ocasión se debe de pronunciar de forma semejante a /s/, sino que debe pronunciarse como /k/, por lo cual no debería de haber ninguna confusión en estos casos. Respecto al resto, nos gustaría aconsejarte escuchar la pronunciación las palabras en castellano de España estándar, como método para aprender a encontrar las diferencias sobre en qué momento es preciso escribir ‘s’ y cuándo ‘c’. Y desde luego, visitar nuestra web y aprender las normas ortográficas que hemos juntado para ti en la portada de este sitio web. Así nunca tendrás dudas sobre si el vocablo que quieres escribir se escribe subsecretaría o es la palabra cubcecretaría.