No debes dudar entre la palabra modificándose y el término modificándoce cuando quieras escribir, debido a que únicamente hay una manera viable para escribir este término como es debido, y es: modificándose. El término modificándoce simplemente no se encuentra en el diccionario de la RAE.
Con el propósito de que puedas acordarte siempre de el modo en que es preciso escribir modificándose, pensamos que puede ayudarte la definición del diccionario:
La vacilación en el momento de escribir vocablos que contienen las letras ‘s’ y ‘c’ pasa con más regularidad en aquellas áreas en donde las dos se pronuncian igual. Esto se produce principalmente en los países latinoamericanos en los que hablan en lengua española, aunque también de igual manera en algunas regiones del sur de España y las Islas Canarias. No vamos a entrar a aportar teorías con relación al porqué de esta forma de pronunciar, puesto que no se corresponde con el objetivo de esta página web, meramente deseamos mencionar que sea como sea, esta pronunciación está aceptada. Igualmente {cabe destacar|es preciso apuntar que la confusión entre ‘s’ y ‘c’ solamente puede tener lugar en determinados casos, dado que la letra ‘c’ cuando antecede a las vocales ‘a’, ‘o’ y ‘u’ nunca jamás tiene su pronunciación de forma similar a /s/, sino que suena como /k/, por lo cual no debería de existir ningún tipo de confusión por este motivo. Por lo demás, nuestra recomendación es escuchar el modo de decir las palabras en castellano de España estándar, para así aprender a diferenciar en qué momento es preciso escribir ‘s’ y cuándo la letra ‘c’. Y desde luego, seguir nuestra web y aprender las normas ortográficas que hemos reunido para ti en la portada de esta página web. De esta forma nunca más sentirás dudas sobre si el término que intentas escribir se escribe modificándose o se trata de la palabra modificándoce.