Jamás debes dudar entre la palabra modificándose y la palabra modificándoze a la hora de escribir, dado que solamente hay una forma viable de escribir este término con corrección, y es: modificándose. La palabra modificándoze simplemente no corresponde a ninguna palabra que se encuentre en el diccionario de la RAE.
Con la finalidad de que te sea más fácil recordar la forma en que deberías escribir modificándose, la definición del diccionario:
La vacilación en el momento de escribir palabras que contienen las letras ‘s’ y ‘c’ pasa con más asiduidad en aquellos sitios en que las dos se pronuncian igual. Esto es sobre todo en los países latinoamericanos en los que se habla castellano, mas también en algunas regiones del sur de la Península Ibérica y las Islas Canarias. No vamos a entrar a exponer teorías con relación al porqué de este modo de pronunciar, puesto que no se corresponde con el propósito de esta página web, meramente queremos mencionar que en cualquier caso, esta manera de pronunciar está aprobada. Asimismo {hay que apuntar|es preciso apuntar que la confusión entre ‘s’ y ‘c’ solamente puede darse en ciertas circunstancias, porque la letra ‘c’ cuando antecede a las vocales ‘a’, ‘o’ y ‘u’ en ningún caso se pronuncia de forma similar a /s/, sino que debe pronunciarse como /k/, por lo cual no debería de existir ningún tipo de confusión en estos casos. Por lo demás, aconsejamos escuchar cómo se pronuncian las palabras en español de España estándar, para así aprender a encontrar las diferencias sobre cuándo es necesario escribir ‘s’ y cuándo ‘c’. Y ciertamente, ser seguidor de nuestra página web y asimilar las normas de ortografía que hemos reunido para ti en el inicio de este sitio web. De este modo ya nunca más tendrás dudas sobre si el término que quieres escribir se escribe modificándose o se trata de la palabra modificándoze.