No deberías dudar entre la palabra pontificias y la palabra pontifisias cuando te veas en la necesidad de escribir, dado que solamente hay una forma viable para escribir este término adecuadamente, y es: pontificias. El término pontifisias sencillamente no aparece en el diccionario de la RAE.
Con la finalidad de que no vuelvas a tener dudas y recuerdes la manera en que debes escribir pontificias, la definición del diccionario:
Las dudas cuando debemos escribir palabras que comprenden las letras ‘s’ y ‘c’ se produce más frecuentemente en aquellos territorios en que las dos se pronuncian igual. Esto ocurre principalmente en los países de América Latina en los cuales se habla español, mas también de igual manera en algunas áreas del sur de España y las Islas Canarias. No es nuestro deseo teorizar acerca del porqué de esta pronunciación, porque no se trata del objetivo de esta página web, solamente pretendemos apuntar a que sea como sea, esta forma de pronunciar está aprobada. Igualmente {hay que decir|es preciso constatar que la confusión entre las letras ‘s’ y ‘c’ solamente puede aparecer en ciertos casos, porque la ‘c’ cuando va delante de las vocales ‘a’, ‘o’ y ‘u’ bajo ninguna circunstancia se debe de pronunciar de forma semejante a /s/, sino que suena como /k/, por lo cual no tendría que haber ningún tipo de confusión en estas circunstancias. Respecto al resto, nuestra recomendación es escuchar el modo de pronunciar las palabras en español peninsular estándar, para así aprender a distinguir cuándo es preciso escribir la letra ‘s’ y cuándo la letra ‘c’. Y ciertamente, ser seguidor de esta web y asimilar las normas de ortografía que hemos recopilado para ti en el inicio de esta web. De esta manera nunca más tendrás dudas sobre si el término que tratas de escribir se escribe pontificias o es la palabra pontifisias.