Nunca deberías dudar entre la palabra secuenciación y la palabra cecuenciación a la hora de escribir, dado que solo nos encontramos con una manera posible para escribir esta palabra con corrección, y es: secuenciación. El término cecuenciación sencillamente no corresponde a ninguna palabra que se encuentre en el diccionario de la RAE.
La inseguridad cuando hay que escribir vocablos que contienen las letras ‘s’ y ‘c’ ocurre con más regularidad en aquellos territorios en que las dos se pronuncian de forma idéntica. Esto se da principalmente en los países latinoamericanos en los que hablan en lengua española, mas también además en algunas áreas del sur de la Península Ibérica y las Islas Canarias. No deseamos trazar teorías acerca del porqué de este modo de pronunciar, porque no es el objetivo de este sitio web, únicamente deseamos mencionar que sea como fuere, esta manera de pronunciar está reconocida. Igualmente {hay que decir|es preciso decir que la confusión entre ‘s’ y ‘c’ tan solo se puede dar en determinados casos, ya que la ‘c’ delante de las vocales ‘a’, ‘o’ y ‘u’ en ningún caso se pronuncia de manera similar a /s/, sino que debe pronunciarse como /k/, por lo cual no tendría que existir ningún tipo de confusión por este motivo. En cuanto a los demás casos, nuestra recomendación es escuchar la pronunciación las palabras en castellano de la Península Ibérica estándar, como método para aprender a encontrar las diferencias sobre cuándo se debe escribir ‘s’ y cuándo la letra ‘c’. Y indudablemente, ser seguidor de esta página web y memorizar las reglas de ortografía que hemos juntado para ti en la portada de este sitio. Así ya nunca jamás experimentarás dudas sobre si el término que tratas de escribir se escribe secuenciación o es la palabra cecuenciación.